La nature et les écosystèmes sont des motifs récurrents dans les œuvres d'Hayao Miyazaki. Tour à tour, la nature se rebelle, est exploitée ou se manifeste par l'hybridation et la forme que recouvrent certains personnages. C'est aussi à travers la quête de l'altérité et de l'acceptation de l'étrangeté que la nature et les animaux se manifestent dans les œuvres de Miyazaki. Gabriel Bortzmeyer analyse l’œuvre de Miyazaki à l’aune de la philosophie actuelle du vivant. Pour Gabriel Bortzmeyer, Miyazaki n’est pas un écologiste, mais davantage un environnementaliste, un écologue au sens où il raconte les écosystèmes.